Blast打分矩阵-Motif检索的福音 发表于 2020-07-31 | 更新于: 2020-07-31 | | 阅读次数: 字数统计: 1.9k 字 | 阅读时长 ≈ 10 分钟 前言众所周知,对于检索精确匹配,模糊匹配,以及特殊的正则匹配。 对于序列检索而言,同样也会序列匹配的要求。至于正则匹配,那就是本文的话题,专业名词叫做Motif检索。序列检索中的正则匹配,是本文的主要话题,专业名词叫做motif。详见https://en.wikipedia.org/wiki/Seq ... 阅读全文 »
Compile and debug NCBI blast+ source code - NCBI blast源码编译调试教程 发表于 2020-07-27 | 更新于: 2020-07-31 | 分类于 blast | | 阅读次数: 字数统计: 525 字 | 阅读时长 ≈ 3 分钟 Environment and tools CLion 2020.1.1(C++ IDE, compiledb doesn’t work in older version) Clang (macOS compile tool) CLion plugins Makefile support、Compi ... 阅读全文 »